Алиев Джалал Алирза оглу родился 30 июня 1928 года в городе Нахчыван.

Он с отличием окончил факультет естественных наук и географии Нахчыванского педагогического института (1944 г.), а затем биологический факультет Азербайджанского государственного университета (1951 г.).  В 1955 году защитил кандидатскую диссертацию на тему «Влияние микроэлементов на развитие и продуктивность пшеницы» по специальности «Физиология растений», в 1971 году стал доктором биологических наук, защитив докторскую диссертацию на тему «Фотосинтетическая активность, минеральное питание и продуктивность растений» (1997 г.)   и получил высокое ученое звание профессора. Джалал Алиев избирался членом-корреспондентом АН Азербайджанской ССР (1976 г.), действительным членом АН Азербайджанской ССР (1980 г.), иностранным членом Российской Академии сельскохозяйственных наук (1995 г.), Национальной аграрной Академии наук Украины и Академии Аграрных наук Республики Беларусь (1996 г.).

Д. Алиев, начавший свою научную деятельность в 1951 году в Институте Земледелия Министерства Сельского Хозяйства Азербайджанской Республики, дослужился до должности заведующего кафедрой физиологии растений и биотехнологии.  Одновременно с этим, он в 1971 году в Институте ботаники АН Азербайджанской ССР он создал научно-исследовательскую группу, развил ее в отдел под названием «Фундаментальные проблемы биологической продуктивности», который отличался большим кадровым потенциалом и материально-технической базой. С 1990 года и до конца своей жизни В. Алиев возглавлял этот отдел.  В 2016 году на базе этого отдела был создан Институт молекулярной биологии и биотехнологий.  В 1981-1990 годах Д.Алиев был академиком-секретарем Отделения биологических наук Национальной Академии наук Азербайджана, в разные годы членом Президиума АН.

В 70-х годах прошлого века Д.Алиев заложил в Азербайджане основы новых направлений биологической науки, в том числе молекулярной биологии, молекулярной генетики, генной и клеточной биотехнологий, математической биологии, компьютерной биологии и биоинформатики, сформировал научную школу, которая под его руководством осуществила глубокие фундаментальные исследования.

Научная деятельность Д. Алиева была посвящена изучению физиологических, биохимических, биофизических и молекулярно-генетических основ фотосинтетической продуктивности сельскохозяйственных растений, главным образом пшеницы, и им были созданы многочисленные высокоурожайные сорта этой культуры.  Под руководством ученого в Азербайджане была разработана Национальная программа по генетическим ресурсам растений и создан Национальный генбанк растений.  Д. Алиев был главным редактором второго издания «Красной книги» Азербайджана (2013 г.).  Он был автором более 700 научных работ, 25 монографий и книг, 25 патентов.  Под научным руководством и консультациями ученого подготовлено 85 кандидатов и 14 докторов наук.  По инициативе и организации Международного общества по исследованиям фотосинтеза в Баку были проведены международные конференции, посвящённые академику Джалалу Алиеву, на тему «Исследование фотосинтеза для устойчивого развития» (2011, 2013 гг.).

Д. Алиев являлся председателем проблемного совета по биологическим наукам Республиканского совета по организации и координации научных исследований и членом ряда научных и оборонных советов, главным редактором журнала «Новости НАНА». (биология и медицинские науки), членом редколлегии журнала «Доклады НАНА», членом и и почетным членом редакционной коллегии ряда международных журналов, был председателем Национального комитета «Биоэтика, этика научных знаний и технологий», созданного в 1999 году при ЮНЕСКО.

Академик Д.Алиев удостоен почетного звания «Заслуженный деятель науки» (1983 г.), награжден орденами Трудового Красного Знамени (1972, 1986 гг.),  Независимости (2003 г.) и Почета (2013 г.) Азербайджанской Республики, орденом Почета Республики Грузия (2003 г.), Почетной грамотой Президента Азербайджанской Республики (2008 г.).  Вместе с академиком И.Гусейновой удостоен премии НАНА «Хасан бек Зардаби» (2014).

 Он был депутатом Милли Меджлиса Азербайджанской Республики четырех созывов (1995, 2000, 2005, 2010 годы).

Академик Д.Алиев скончался 1 февраля 2016 года в Баку и был похоронен на Первой Аллее почетного захоронения.