Сотрудничество между Бакинским государственным университетом и Институтом молекулярной биологии и биотехнологий МНО АР были установлены академиком Джалалом Алиевым в 80-х годах прошлого века и в настоящее время успешно продолжаются генеральным директором института академиком Ирадой Гусейновой. Ежегодно ученые института принимают участие в учебном процессе, в подготовке магистров в университете, а студенты проходят производственную практику в научно-исследовательских лабораториях института. 16 марта 2023 года был подписан Меморандум о взаимопонимании между Бакинским государственным университетом и Институтом молекулярной биологии и биотехнологий о совместном осуществлении научно-исследовательской деятельности. В этом году согласно распоряжению Президента, НАНА № 205 от 01.09.2023 12 магистров, обучающихся в институте по специальностям «Молекулярная биология», «Биотехнология», «Биохимия» и «Физиология растений» были переведены в Бакинский государственный университет и в процесс обучения были вовлечены профессорско-преподавательский состав университета и института. В магистратуре уже начались занятия. В аудиториях института проводились занятия по методам исследования молекулярной биологии, молекулярным механизмам передачи биологических сигналов и молекулярной фитопатологии. Генеральный директор института академик Ирада Гусейнова поприветствовала студентов и пожелала им успехов в новом учебном году.